Claude CodeとObsidianを連携する方法｜準備・設定・使い方と注意点

「Obsidianにメモを溜めてきたけれど、増えすぎて整理が追いつかない」「Claude Codeを入れたものの、プログラミング以外の使い道が分からない」という方は多いのではないでしょうか。

Obsidianは、メモをパソコンの中のフォルダにMarkdown（見出しや箇条書きを記号で書く、ふつうの文章ファイル）として保存するメモアプリです。一方、Claude Codeは、フォルダの中のファイルを読み書きしながら作業を進めるAIです。Obsidianのメモはただのファイルなので、Claude Codeからそのまま読み書きできます。特別なプラグインや連携の設定がなくても、保管庫（Obsidianのメモをまとめて入れておくフォルダ）で Claude Code を起動すれば使い始められます。

この記事では、連携の仕組み、Windowsでの準備と最初の起動、メモのルールをClaudeに伝える方法、頼み方の例、読ませたくないメモを守る設定、拡張の選び方までを順に解説します。内容は2026年10月時点の公式情報をもとにしています。バージョンや提供状況は変わることがあるため、最新の情報は各公式ページもあわせて確認してください。

Claude CodeとObsidianの関係

最初に、2つがどのようにつながるのかを整理します。ここを押さえておくと、あとの設定や注意点の意味が分かりやすくなります。

つなぐのは「フォルダ」

Obsidianの公式ヘルプでは、メモは保管庫（vault）と呼ばれるパソコン内のフォルダに、プレーンテキストのMarkdownファイルとして保存されると説明されています。ほかのエディタやファイル管理ソフトからも扱えて、外部で変更されたファイルはObsidianに反映されます。

Claude Codeの公式ドキュメントにも、この使い方に触れた項目があります。「Claude Codeは任意のディレクトリで動く。ノートの保管庫やドキュメント用のフォルダ、Markdownファイルの集まりの中で実行すれば、コードと同じように内容を検索・編集・整理できる」という趣旨の説明です。また、Claudeはツールを呼ぶたびにファイルを読み直すので、Obsidianなど別のアプリで行った編集も、次に読むときには反映されます。

つまり、ObsidianとClaude Codeは直接やりとりしているのではありません。同じフォルダのファイルを、それぞれのアプリが読み書きしているという関係です。この点は、あとの「注意点」にも関わるので覚えておいてください。

それぞれの役割

料金について補足します。Obsidianの公式の料金ページでは、本体は無料で、仕事で使う場合も商用ライセンスの購入は必須ではないとされています。有料なのは、端末間の同期サービス（Sync）、メモをWebで公開するサービス（Publish）、任意で購入できる商用ライセンスなどです。2026年10月時点の表示は、Syncが月4ドル（年払い。月払いは5ドル）、Publishが月8ドル（年払い。月払いは10ドル）です。

Claude Code側は、Claudeの有料プラン（Pro・Max・Team・Enterprise）か、Claude Consoleのアカウントなどが必要です。料金の詳しい内容は、別の記事で解説しています。

つなぎ方は3つ

「Claude CodeとObsidianの連携」と言っても、やり方はいくつかあります。まず、いちばん簡単な方法から試すのがおすすめです。

この記事では、1つ目を中心に、2つ目・3つ目は後半で位置づけと注意点を説明します。Claude（チャット）とObsidianをつなぐ方法は、別の記事で扱っています。

連携の準備と最初の起動

ここでは、Windowsのパソコンで、保管庫のフォルダからClaude Codeを起動するまでを説明します。MacやLinuxでも考え方は同じです。

用意するもの

• Obsidian：公式サイトから入れます。Windows、macOS、Linux、iOS、Androidに対応しています。すでに使っている保管庫があれば、そのまま使えます
• Claude Code：公式のインストール手順で入れます。ログインにはClaudeの有料プランなどが必要です
• Git for Windows：公式のクイックスタートでは、Windowsでは入れておくことが推奨されています。入っていない場合は、Claude Codeは代わりにPowerShellをシェルとして使います

Claude Codeの入れ方は、別の記事で画面つきで詳しく解説しています。

保管庫のフォルダで起動する手順

1. 保管庫のフォルダを確認するエクスプローラーで、Obsidianの保管庫になっているフォルダを開きます。アドレスバーに表示されているパスを、あとで使うのでコピーしておきます。
2. PowerShellを開くスタートメニューから「PowerShell」を探して開きます。入力欄が出た黒い（または青い）画面がターミナルです。
3. 保管庫のフォルダに移動する次のように入力して、Enterキーを押します。パスは、手順1でコピーしたものに置き換えてください。フォルダ名に空白や日本語が含まれていても、引用符で囲めば使えます。

   cd "C:\Users\（ユーザー名）\Documents\MyVault"

4. Claude Codeを起動する次のコマンドを入力します。初回は、ブラウザが開いてログインを求められます。

   claude

5. フォルダを信頼するか聞かれたら確認する初めて開くフォルダでは、作業内容を確認するための画面が出ます。保管庫は自分のフォルダなので、内容を読んだうえで進めます。
6. 最初の質問を送る入力欄に、次のように入力します。ここまでできれば、連携は完了です。

   このフォルダの構成を教えてください。メモは全部で何件ありますか？

Claude Codeは、起動したフォルダを作業場所として、その中のファイルを読めるようになります。最初の質問で、フォルダの構成やメモの件数が返ってくれば、ObsidianのメモをClaudeが読めている状態です。

保管庫が別の場所にあるとき

すでに別のフォルダでClaude Codeを使っていて、保管庫は別の場所にある場合は、追加のフォルダとして指定できます。公式ドキュメントでは、起動時に --add-dir <パス> を付ける、セッション中に /add-dir を使う、設定ファイルの additionalDirectories に書く、の3つが案内されています。

claude --add-dir "C:\Users\（ユーザー名）\Documents\MyVault"

ただし、追加したフォルダに入っているCLAUDE.mdは、初期状態では読み込まれません。保管庫のルールを書いたCLAUDE.mdを読ませたい場合は、環境変数 CLAUDE_CODE_ADDITIONAL_DIRECTORIES_CLAUDE_MD=1 を設定します。迷ったら、保管庫のフォルダで直接起動するのが確実です。

CLAUDE.mdでルールを伝える

Claude Codeは、起動するたびに会話の内容を忘れた状態から始まります。毎回「このフォルダはこう使っている」と説明するのは大変なので、CLAUDE.md（クロード・エムディー）というファイルに書いておくと、毎回の起動時に読み込まれます。

CLAUDE.mdの置き場所

公式ドキュメントでは、プロジェクト用のCLAUDE.mdは、./CLAUDE.md または ./.claude/CLAUDE.md に置くとされています。保管庫のフォルダの直下に作れば、そこで起動したときに読み込まれます。読み込まれているかどうかは、Claude Codeの中で /context を実行し、「Memory files」の一覧を見て確認できます。

/init というコマンドで、CLAUDE.mdの下書きを自動で作ることもできます。ただ、これはもともとプログラムのフォルダを読んで、ビルド方法やテストの手順を書き出す機能です。メモだけの保管庫でどんな内容になるかは公式には説明がないため、自分の言葉で書く方が確実です。

書くことの例

保管庫のCLAUDE.mdには、次のようなことを書いておくと役に立ちます。

# この保管庫のルール

## フォルダの使い方
- Inbox/ : 未整理のメモ。ここから他のフォルダへ振り分ける
- Projects/ : 進行中の案件。1案件に1フォルダ
- Daily/ : 日次ノート。ファイル名は YYYY-MM-DD.md
- Archive/ : 終わった案件。編集しない
- Private/ : 個人的なメモ。読まない

## 書き方
- ノート同士のリンクは [[ノート名]] の形式で書く
- 先頭に properties（tags, date）を付ける
- 日本語で、です・ます調ではなく常体で書く

## 守ること
- メモを削除しない。不要と思ったら一覧で提案する
- 移動や名前の変更をする前に、対象の一覧を見せて確認を取る

このように、フォルダの役割、書き方の決まり、してはいけないことの3つを書いておくのが基本です。公式ドキュメントでも、「Use 2-space indentation」のように、確認できる形で具体的に書くことが勧められています。「きれいに整理して」のような曖昧な指示より、「Inboxのメモは、内容に合うProjectsのフォルダに移す」のほうが、意図どおりに動きやすくなります。

Obsidianのリンクの書き方や properties についても、ルールに入れておくと書式がそろいます。Obsidianの公式ヘルプによると、内部リンクは既定で [[ノート名]] の形式（ウィキリンク）で、設定でMarkdown形式のリンクに切り替えることもできます。properties は、ノートの先頭にYAML形式で書かれる、タグや日付などの情報です。自分の保管庫がどちらの形式かを確認して、書いておきましょう。

長さと書き方の目安

公式ドキュメントによると、CLAUDE.mdは1ファイルあたり200行以内が目安で、長すぎるとClaudeが指示を守りにくくなります。また、矛盾する指示が2つあると、どちらかが選ばれてしまうことがあります。次の点を意識すると、読み込まれやすくなります。

• 見出しと箇条書きで、項目ごとに整理する
• 「Archive/ は編集しない」のように、具体的に書く
• フォルダ別の細かい手順は、別のファイルやスキルに分ける
• 古くなった指示は削除する

できることと頼み方

保管庫でClaude Codeを使うと、メモを1つずつ開いてやっていた作業を、まとめて頼めるようになります。ここでは、頼み方の例を紹介します。

頼める作業の例

ここで大事なのは、「変更する前に一覧を見せて」と一言添えることです。まとめて処理できる分、間違いが起きたときの影響も大きくなります。一覧を確認して、問題がなければ「その内容で実行して」と伝える、という2段階にすると安心です。

ファイルを指定して頼む

特定のメモを対象にしたいときは、@ を付けてファイルやフォルダを指定できます。公式ドキュメントでは、@ を入力するとパスの候補が表示され、ファイルの内容や、フォルダの一覧を会話に含められると説明されています。

@Projects/A社/議事録_2026-10-12.md を読んで、決まったことと宿題を箇条書きにしてください

1つのファイルは、読み取りの上限（既定では25,000トークン）に収まる場合に内容が含まれます。256KBより大きなテキストファイルは含められません。非常に長いメモは、章ごとに分けるか、必要な部分を指定して頼みましょう。

グラフやバックリンクの扱い

Obsidianのグラフ表示やバックリンク（そのメモを指しているリンクの一覧）は、Obsidianが画面に描いているものです。Claude Codeはそれらを画面として見るわけではなく、フォルダの中の文字列を検索して調べます。たとえば「[[A社]] と書かれているメモを全部挙げて」と頼めば、そのとおりに検索して一覧にしてくれます。

この違いを知っておくと、「Obsidianの画面で見えているものが、Claudeにも見えているはず」という思い込みによる行き違いを防げます。

大きな変更は「計画」から始める

数十件以上のメモを動かす作業では、最初に計画を立てさせるのが安全です。公式ドキュメントのプランモード（計画モード）では、Claudeがファイルを読んで計画を示すだけで、承認するまで編集をしません。claude --permission-mode plan で起動するか、セッション中に Shift+Tab を押して切り替えられます。

安全に使うための設定

メモには、個人的な記録や、取引先の情報が入っていることがあります。Claude Codeはファイルを書き換えられるので、使い始める前に次の準備をしておきましょう。

バックアップを取る

最初にやっておきたいのは、保管庫のバックアップです。フォルダごとコピーしておくだけでも、取り返しのつかない事態を防げます。

Gitを使える環境であれば、保管庫を Git で管理しておくと、変更の履歴が残り、元に戻せます。Obsidianの公式ヘルプにも、保管庫をGitで管理する場合は、メモを開くたびに変わる .obsidian/workspace.json などを .gitignore に入れておくとよい、という注意書きがあります。

権限のモードを知っておく

Claude Codeは、既定では、ファイルを編集する前に確認を求めます（手動モード）。公式ドキュメントに載っている主なモードは次のとおりです。

モードは Shift+Tab で切り替えられます。慣れるまでは、手動のまま、確認画面で何が変わるかを読む習慣をつけておくと安心です。

読ませたくない場所を設定で止める

個人的な日記や、取引先の機密を書いたメモなどは、Claudeに読ませない設定ができます。公式ドキュメントでは、Read の deny（拒否）ルールで、ファイルやフォルダへの読み取りを止められると案内されています。保管庫の .claude/settings.json に、次のように書きます。

{
  "permissions": {
    "deny": [
      "Read(./Private/**)",
      "Edit(./Archive/**)"
    ]
  }
}

1行目は Private フォルダの中身を読ませない設定、2行目は Archive フォルダの中身を編集させない設定です。公式ドキュメントによると、deny ルールは allow（許可）ルールより先に評価されるため、ほかの許可設定で上書きされません。また、Read を拒否したパスには、編集や新規作成もできなくなります。

間違えたときに元に戻す

Claude Codeは、ファイルを編集するたびにチェックポイントを記録しています。/rewind を実行するか、入力欄が空の状態で Esc を2回押すと、過去の時点にコードと会話を戻せます。公式ドキュメントでは、直近100件のチェックポイントが保持され、保存の期間は初期設定で約30日とされています。

ただし、Bashコマンドで行われた変更（削除・移動・コピーなど）は、rewindでは元に戻りません。また、Claude Codeの外で自分が行った編集も対象外です。公式でも、チェックポイントはバージョン管理の代わりではないとされています。大きな作業の前にバックアップやコミットを取ることは、省かないでください。

メモの内容はどこに送られるのか

Claude Codeがメモを読むと、その内容は、プロンプトと同じようにAnthropicのサーバーに送られて処理されます。公式のデータ利用のページでは、通信はTLSで暗号化されると説明されています。保持や学習の扱いは、プランによって異なります。

また、Claude Codeは会話の記録を、パソコンの ~/.claude/projects/ 以下に平文で保存しています（初期設定では30日間）。保管庫の中身が会話の記録として残ることになるので、共用のパソコンで使う場合は注意してください。

顧客の個人情報や取引先の機密を含むメモを扱うなら、先に契約の種類と設定を確認しておきましょう。会社として使う場合は、渡してよい情報の範囲を決めてから始めるのが基本です。

コミュニティプラグインを使うときの注意

Obsidianには、有志が作るコミュニティプラグインがあり、Claude Codeと連携するものも見つかります。ただし、Obsidianの公式ヘルプでは、次のように注意されています。

• Obsidianは、既定で「制限モード（Restricted mode）」で動き、外部のコードは実行されない
• プラグインに細かい権限は付けられず、Obsidianと同じ権限で動く。パソコンのファイルを読んだり、インターネットに接続したり、ほかのプログラムを入れたりできる
• Obsidianはプラグインの全バージョンを自動でスキャンしているが、機密性の高い情報を扱うなら、利用前に独自の安全性の確認を行うことが勧められている

保管庫に重要なメモが入っているなら、入れるプラグインは、作者や更新状況を確認して、必要最小限にとどめましょう。この記事で紹介する、保管庫のフォルダでClaude Codeを起動する方法は、プラグインを入れる必要がありません。

さらに便利にする方法

基本の使い方に慣れたら、よく使う手順を覚えさせたり、外のツールとつないだりして、さらに便利にできます。どれも必須ではありません。困ったときの選択肢として知っておいてください。

スキル：よく使う手順を登録する

スキルは、「この作業はこの手順で」という指示書を登録しておく仕組みです。公式ドキュメントでは、SKILL.md というファイルを次の場所に置くと説明されています。

たとえば「週次レビュー」というスキルを作っておけば、毎週 /weekly-review のように呼び出すだけで、同じ手順で振り返りを作れます。CLAUDE.mdに毎回必要なルールを書き、特定の作業の手順はスキルに分ける、という使い分けが公式でも勧められています。

Obsidian公式のCLIを使う

Obsidianには、ターミナルから操作するためのコマンドラインツール（CLI）があります。公式ヘルプによると、Obsidian 1.12のインストーラー（1.12.7以降）で使え、「設定」→「一般」から「Command line interface」を有効にして登録します。Windowsでは、登録後にターミナルを再起動すると使えるようになります。

使い方は obsidian search query="議事録" のように、コマンド名と パラメーター=値 を組み合わせます。デイリーノートへの追記、ノートの作成、タスクやタグの一覧などのコマンドが公式ヘルプに載っています。ただし、CLIはObsidianが起動している状態で、その実行中のアプリに接続して動きます（起動していないときは、最初のコマンドで起動される）。Claude Codeでフォルダを読み書きする方法だけで足りる作業が多いため、まずは基本の方法を使い、必要になってから導入すれば十分です。

obsidian-skills：書式を覚えさせる

GitHubには、Obsidian向けのスキルを集めた「obsidian-skills」というリポジトリが公開されています。READMEによると、Obsidian独自のMarkdown（ウィキリンク、埋め込み、コールアウト、properties）、Bases（.base ファイル）、JSON Canvas（.canvas ファイル）、Obsidian CLIなどを扱うスキルが入っています。ライセンスはMITです。

Claude Codeへの入れ方として、READMEには2通りが書かれています。

• Claude Code の中で、次の2つのコマンドを実行する

  /plugin marketplace add kepano/obsidian-skills
  /plugin install obsidian@obsidian-skills

• リポジトリの内容を、保管庫の .claude フォルダにコピーする

これはObsidianの公式サイトの機能ではなく、GitHub上の公開リポジトリです。入れる前に、中のファイルを読んで、何をするスキルなのかを確認してください。

MCP：外のサービスとつなぐ

MCP（Model Context Protocol）は、Claude Codeを外部のツールやデータベース、APIとつなぐための共通の仕組みです。公式ドキュメントでは、次のコマンドでサーバーを追加します。

claude mcp add --transport http <名前> <URL>

保管庫のメモの読み書きだけなら、MCPは必要ありません。使いどころは、たとえば「カレンダーやメモ以外のサービスの情報を、保管庫のノートに取り込みたい」といった場面です。公式ドキュメントでは、信頼できるサーバーだけをつなぐこと、外部のコンテンツを取得するサーバーはプロンプトインジェクション（文書に仕込まれた悪意のある指示）の危険があることが注意されています。

Web Clipperで集めたメモを整理する

Obsidian Web Clipperは、Webページの内容を保管庫に保存できる、無料のブラウザ拡張機能です。Chrome、Firefox、Safari、Edgeなどに対応しています。集めたページは保管庫のフォルダにファイルとして入るので、Claude Codeに「Clippingsフォルダの記事を読んで、案件ごとに要点を整理して」と頼めます。集める作業はObsidian、整理する作業はClaude Codeという分担です。

うまく動かないとき

つまずきやすい点と、確認の順番を表にまとめました。

Obsidianの公式ヘルプには、メタデータのキャッシュ（グラフやアウトラインを表示するためにObsidianが持っている情報）がファイルの状態とずれた場合に、「ファイルとリンク」の設定から再構築できると書かれています。Claudeがファイルを大量に書き換えたあとで、表示がおかしいと感じたときの選択肢になります。

よくある質問

まとめ

メモの整理を任せられるようになると、集めた情報を「読み返す」手間が大きく減ります。まずは保管庫のコピーを使い、読むだけの依頼から試してみてください。

社内でナレッジを蓄積している場合は、どのメモを任せてよいか、権限や保存先をどう決めるかといった整理が必要になります。INTERCREATE JAPANでは、Claude Codeの導入から、社内のルールづくり、使い続けられる仕組みの整備までをお手伝いしています。